Warum ist das legendäre Atlantis versunken? Niemand weiß es bis heute. Aber an einem besonders regnerischen Tag reist Lilli mit Hektor in die Stadt der Vergangenheit und findet heraus, was passiert ist.
Lilli und Hektor sind in Ägypten und nehmen an Ausgrabungen in der Wüste teil. Dabei lösen sie das Rätsel um einen sagenumwobenen Pharao.