Als die Seepferdchen-Freundinnen Gomi, Schnebbi und Plicki am Morgen in der Tanzschule ankommen, ist ihre Lehrerin ganz außer sich: Direktor Phyllopteryx ist verschwunden. Hoffentlich wurde der berühmte Algenforscher nicht von den gefräßigen Pyjamahaien gefressen! Aber schon bald entdeckt die schlaue Plicki auf dem Stein des Direktors eine verschlüsselte Nachricht. Nach langem Hin und Her sind die Seepferdchen sicher, dass der Direktor entführt wurde, und zwar ins legendäre Atlantis! Jetzt müssen sie nur noch herausfinden, wie sie in die sagenumwobene versunkene Stadt kommen, um ihn zu befreien. Zum Glück stehen ihnen dabei viele bunte Wassertiere zur Seite!